MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus S110 chromosome 1

Total Repeats: 157715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012791	T	6	6	22	27	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012791	AGC	2	6	107	112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813020
3	NC_012791	GAC	2	6	154	159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813020
4	NC_012791	CGC	2	6	234	239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813020
5	NC_012791	CG	3	6	350	355	0 %	0 %	50 %	50 %	239813020
6	NC_012791	GGCC	2	8	360	367	0 %	0 %	50 %	50 %	239813020
7	NC_012791	GAG	2	6	373	378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239813020
8	NC_012791	TGG	2	6	434	439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813020
9	NC_012791	GC	4	8	460	467	0 %	0 %	50 %	50 %	239813020
10	NC_012791	CGC	3	9	465	473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813020
11	NC_012791	CGG	2	6	525	530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813020
12	NC_012791	GCT	2	6	576	581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813020
13	NC_012791	CGA	2	6	669	674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813020
14	NC_012791	CTCG	2	8	693	700	0 %	25 %	25 %	50 %	239813020
15	NC_012791	CGA	2	6	714	719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813020
16	NC_012791	TTC	2	6	727	732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239813020
17	NC_012791	CAA	2	6	735	740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239813020
18	NC_012791	CGCA	2	8	745	752	25 %	0 %	25 %	50 %	239813020
19	NC_012791	GAA	2	6	754	759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239813020
20	NC_012791	TTC	2	6	760	765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239813020
21	NC_012791	CTG	2	6	781	786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813020
22	NC_012791	AAG	2	6	790	795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239813020
23	NC_012791	TGA	2	6	806	811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239813020
24	NC_012791	GCC	2	6	897	902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813020
25	NC_012791	CAA	2	6	933	938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239813020
26	NC_012791	GC	4	8	940	947	0 %	0 %	50 %	50 %	239813020
27	NC_012791	GAA	2	6	967	972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239813020
28	NC_012791	CTT	2	6	978	983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239813020
29	NC_012791	GC	3	6	1087	1092	0 %	0 %	50 %	50 %	239813020
30	NC_012791	CTG	2	6	1108	1113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813020
31	NC_012791	AGA	2	6	1151	1156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239813020
32	NC_012791	ACT	2	6	1166	1171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239813020
33	NC_012791	AAG	2	6	1201	1206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239813020
34	NC_012791	AGA	2	6	1268	1273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239813020
35	NC_012791	CGG	2	6	1299	1304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813020
36	NC_012791	ACG	2	6	1315	1320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813020
37	NC_012791	TGC	2	6	1322	1327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813020
38	NC_012791	CAG	2	6	1357	1362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813020
39	NC_012791	CAG	2	6	1378	1383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813020
40	NC_012791	AAGAG	2	10	1487	1496	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012791	GAA	2	6	1497	1502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012791	CGC	2	6	1541	1546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813021
43	NC_012791	TGGC	2	8	1558	1565	0 %	25 %	50 %	25 %	239813021
44	NC_012791	GCG	2	6	1574	1579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813021
45	NC_012791	CGG	2	6	1622	1627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813021
46	NC_012791	CAGCTG	2	12	1629	1640	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	239813021
47	NC_012791	ACC	2	6	1641	1646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813021
48	NC_012791	CAC	2	6	1670	1675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813021
49	NC_012791	CGG	2	6	1685	1690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813021
50	NC_012791	CGA	2	6	1691	1696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813021
51	NC_012791	CAC	3	9	1706	1714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813021
52	NC_012791	GC	4	8	1720	1727	0 %	0 %	50 %	50 %	239813021
53	NC_012791	GCCG	2	8	1754	1761	0 %	0 %	50 %	50 %	239813021
54	NC_012791	GGC	2	6	1809	1814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813021
55	NC_012791	GCCG	2	8	1841	1848	0 %	0 %	50 %	50 %	239813021
56	NC_012791	GCC	2	6	1872	1877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813021
57	NC_012791	CTA	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239813021
58	NC_012791	AGC	2	6	2005	2010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813021
59	NC_012791	TGG	2	6	2017	2022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813021
60	NC_012791	TCG	2	6	2049	2054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813021
61	NC_012791	TTC	2	6	2092	2097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239813021
62	NC_012791	CTG	2	6	2127	2132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813021
63	NC_012791	AAC	2	6	2169	2174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239813021
64	NC_012791	GGC	2	6	2193	2198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813021
65	NC_012791	CG	3	6	2289	2294	0 %	0 %	50 %	50 %	239813021
66	NC_012791	CGAG	2	8	2332	2339	25 %	0 %	50 %	25 %	239813021
67	NC_012791	AAC	2	6	2394	2399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239813021
68	NC_012791	CGG	2	6	2441	2446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813021
69	NC_012791	ACCT	2	8	2475	2482	25 %	25 %	0 %	50 %	239813021
70	NC_012791	CGT	2	6	2588	2593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813021
71	NC_012791	GA	3	6	2726	2731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012791	AGA	2	6	2755	2760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239813022
73	NC_012791	CGCC	2	8	2835	2842	0 %	0 %	25 %	75 %	239813022
74	NC_012791	CAC	2	6	2948	2953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813022
75	NC_012791	GGT	2	6	2965	2970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813022
76	NC_012791	CGA	2	6	2983	2988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813022
77	NC_012791	CGA	2	6	3007	3012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813022
78	NC_012791	TCG	2	6	3015	3020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813022
79	NC_012791	GAC	2	6	3092	3097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813022
80	NC_012791	GGC	2	6	3152	3157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813022
81	NC_012791	GGC	2	6	3188	3193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813022
82	NC_012791	GGCGTG	2	12	3200	3211	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	239813022
83	NC_012791	TGC	2	6	3237	3242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813022
84	NC_012791	TGG	2	6	3246	3251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813022
85	NC_012791	GCG	2	6	3253	3258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813022
86	NC_012791	ATC	2	6	3353	3358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239813022
87	NC_012791	GAGCT	2	10	3464	3473	20 %	20 %	40 %	20 %	239813022
88	NC_012791	AAC	2	6	3479	3484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239813022
89	NC_012791	GAC	2	6	3527	3532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813022
90	NC_012791	CGG	2	6	3544	3549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813022
91	NC_012791	TCA	2	6	3570	3575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239813022
92	NC_012791	GCCG	2	8	3628	3635	0 %	0 %	50 %	50 %	239813022
93	NC_012791	CGG	2	6	3643	3648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813022
94	NC_012791	GCAC	2	8	3657	3664	25 %	0 %	25 %	50 %	239813022
95	NC_012791	GTGCT	2	10	3713	3722	0 %	40 %	40 %	20 %	239813022
96	NC_012791	CAA	2	6	3727	3732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239813022
97	NC_012791	CGG	2	6	3748	3753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813022
98	NC_012791	CACC	2	8	3754	3761	25 %	0 %	0 %	75 %	239813022
99	NC_012791	GC	3	6	3772	3777	0 %	0 %	50 %	50 %	239813022
100	NC_012791	TCA	2	6	3792	3797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239813022
101	NC_012791	GAA	2	6	3809	3814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239813022
102	NC_012791	AAG	2	6	3827	3832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239813022
103	NC_012791	GAC	2	6	3854	3859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813022
104	NC_012791	TGC	2	6	3875	3880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813022
105	NC_012791	GC	4	8	3952	3959	0 %	0 %	50 %	50 %	239813022
106	NC_012791	TCG	2	6	3972	3977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813022
107	NC_012791	GCC	2	6	3978	3983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813022
108	NC_012791	ACG	2	6	4014	4019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813022
109	NC_012791	ATC	2	6	4025	4030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239813022
110	NC_012791	TCG	2	6	4041	4046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813022
111	NC_012791	GCC	2	6	4049	4054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813022
112	NC_012791	GC	3	6	4070	4075	0 %	0 %	50 %	50 %	239813022
113	NC_012791	CGC	2	6	4094	4099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813022
114	NC_012791	TGG	2	6	4182	4187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813022
115	NC_012791	CCG	2	6	4197	4202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813022
116	NC_012791	GC	3	6	4283	4288	0 %	0 %	50 %	50 %	239813022
117	NC_012791	GCT	2	6	4297	4302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813022
118	NC_012791	CCA	2	6	4365	4370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813022
119	NC_012791	GCGG	2	8	4373	4380	0 %	0 %	75 %	25 %	239813022
120	NC_012791	GAC	2	6	4388	4393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813022
121	NC_012791	ACC	2	6	4416	4421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813022
122	NC_012791	CAT	4	12	4423	4434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239813022
123	NC_012791	CCGACG	2	12	4437	4448	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	239813022
124	NC_012791	GCT	3	9	4471	4479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813022
125	NC_012791	CTT	2	6	4483	4488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239813022
126	NC_012791	GCC	2	6	4540	4545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813022
127	NC_012791	CGG	2	6	4651	4656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813022
128	NC_012791	ACC	2	6	4667	4672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813022
129	NC_012791	CG	3	6	4699	4704	0 %	0 %	50 %	50 %	239813022
130	NC_012791	CG	3	6	4732	4737	0 %	0 %	50 %	50 %	239813022
131	NC_012791	GC	3	6	4768	4773	0 %	0 %	50 %	50 %	239813022
132	NC_012791	CTCGAC	2	12	4793	4804	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	239813022
133	NC_012791	ACC	2	6	4865	4870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813022
134	NC_012791	GCCG	2	8	4876	4883	0 %	0 %	50 %	50 %	239813022
135	NC_012791	AGC	2	6	4889	4894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813022
136	NC_012791	GCT	2	6	4921	4926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813022
137	NC_012791	GCC	3	9	4935	4943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813022
138	NC_012791	AGC	2	6	4961	4966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813022
139	NC_012791	CGC	2	6	5002	5007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813022
140	NC_012791	GCC	2	6	5018	5023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813022
141	NC_012791	CCT	2	6	5038	5043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239813022
142	NC_012791	AGC	2	6	5045	5050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813022
143	NC_012791	CCG	2	6	5065	5070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813022
144	NC_012791	GGCGAA	2	12	5072	5083	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	239813022
145	NC_012791	GAA	2	6	5093	5098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239813022
146	NC_012791	ACC	2	6	5213	5218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813022
147	NC_012791	GCC	2	6	5235	5240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813022
148	NC_012791	TGC	2	6	5241	5246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813022
149	NC_012791	CGA	2	6	5257	5262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813022
150	NC_012791	CGA	2	6	5302	5307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813022
151	NC_012791	CCGCG	2	10	5315	5324	0 %	0 %	40 %	60 %	239813022
152	NC_012791	GCGG	2	8	5347	5354	0 %	0 %	75 %	25 %	239813022
153	NC_012791	GAA	2	6	5377	5382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_012791	A	6	6	5404	5409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_012791	T	8	8	5432	5439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_012791	TTC	2	6	5442	5447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_012791	CG	3	6	5473	5478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
158	NC_012791	CAG	2	6	5553	5558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_012791	ACG	2	6	5698	5703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813023
160	NC_012791	GGAC	2	8	5714	5721	25 %	0 %	50 %	25 %	239813023
161	NC_012791	CAC	2	6	5761	5766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813023
162	NC_012791	GCCG	2	8	5894	5901	0 %	0 %	50 %	50 %	239813023
163	NC_012791	GCA	2	6	5912	5917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813023
164	NC_012791	TTC	2	6	5926	5931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239813023
165	NC_012791	GGA	2	6	5940	5945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239813023
166	NC_012791	TCG	2	6	5953	5958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813023
167	NC_012791	ACA	2	6	5969	5974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239813023
168	NC_012791	CTG	2	6	6001	6006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813023
169	NC_012791	GGT	2	6	6012	6017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813023
170	NC_012791	TCG	2	6	6035	6040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813023
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179	NC_012791	GGA	2	6	6216	6221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239813023
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189	NC_012791	GCC	2	6	6714	6719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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257	NC_012791	TGCG	2	8	9294	9301	0 %	25 %	50 %	25 %	239813027
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265	NC_012791	CGC	3	9	9558	9566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813027
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267	NC_012791	GGC	2	6	9616	9621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813027
268	NC_012791	CAGCTG	2	12	9635	9646	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	239813027
269	NC_012791	CACG	2	8	9655	9662	25 %	0 %	25 %	50 %	239813027
270	NC_012791	GCA	2	6	9700	9705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813027
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272	NC_012791	GCC	2	6	9778	9783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813027
273	NC_012791	GC	3	6	9795	9800	0 %	0 %	50 %	50 %	239813027
274	NC_012791	GCT	2	6	9814	9819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813027
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277	NC_012791	GCC	2	6	9883	9888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813028
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291	NC_012791	TGC	2	6	10416	10421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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296	NC_012791	ATT	2	6	10540	10545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_012791	AAC	2	6	10553	10558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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396	NC_012791	CGGC	2	8	13670	13677	0 %	0 %	50 %	50 %	239813032
397	NC_012791	TCG	2	6	13681	13686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813032
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399	NC_012791	GCT	3	9	13712	13720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813032
400	NC_012791	GCA	2	6	13790	13795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813032
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